Har du provat att justera RGB-pottarna på nackkortet (vissa chassi har dem direkt på chassikortet, jag minns inte vad som sitter i RFM som standard)?
Det borde sitta 3 (eller 6) pottar för Röd, Grön & Blå Gain (och eventuellt motsvarande cutoff) som man kan justera färgerna med. Väldigt vanligt på arkadspel att man måste justera in dem, och ibland kan någon av pottarna gå sönder vilket resulterar i konstiga färgproblem likt det du beskriver.